Компания Google DeepMind представила AlphaGenome Atlas, онлайн-репозиторий с результатами вычислений модели AlphaGenome. Ресурс содержит предсказания для всех 9 миллиардов возможных однонуклеотидных замен в эталонном геноме человека. Ранее исследователям приходилось самостоятельно запускать ресурсоемкую модель, теперь же доступ к данным стал проще благодаря веб-интерфейсу и внедрению «оценки влияния» (impact score) для каждого варианта. Для создания атласа объемом около 1 петабайта разработчикам потребовалось ускорить вычисления в 80 раз, используя дистилляцию моделей и оптимизацию GPU-ядер. Несмотря на масштаб, эксперты отмечают ограничения: модель учитывает сегменты до 1 млн пар оснований, что может быть недостаточно для анализа удаленных энхансеров. Также специалисты предупреждают, что упрощенная оценка влияния может быть неверно истолкована. Ресурс доступен для некоммерческих исследований.
Google DeepMind представила AlphaGenome Atlas с прогнозами для 9 млрд вариантов ДНК
Google DeepMind выпустила AlphaGenome Atlas — базу данных с предсказаниями влияния 9 миллиардов возможных однобуквенных изменений в геноме человека на регуляцию генов.




